1. 滿足抗體選擇的基本條件
靶蛋白特異性:確定目的細胞的特異性表面標記或者胞內標記,知道您要檢測什么。
種屬:嚴格按照待測樣本種屬選擇抗體來源,流式抗體基本無法進行種屬間交叉反應。
應用領域:可用于流式實驗,說明書中明確標注經FC實驗測試,有實驗數據圖和用量說明;
抗體克隆號:一般選擇參考文獻上提到的克隆;同一抗體多個克隆號的情況下,可以選擇熒光標記種類zui多的那個克隆。
2. 確定流式細胞儀的參數配置
在設計流式方案前,根據可能需要同時檢測指標的多少數量,先確定需要在哪臺使用流式細胞儀檢測的型號,對該儀器的參數配置,要了解以下幾個方面信息:
激光器:常見的流式細胞儀有488nm和635nm633nm兩個激光器,但有些機器在購買時因某些原因,只裝了一個488nm激光器,所以需要注意型號相同的機器也未必激光配置相同。
濾光片:也就是有幾個檢測通道,這決定了你zui多可以同時檢測幾個指標。
儀器的具體型號:有助于再次確定檢測通道。因為同一個熒光在不同的流式細胞儀上檢測,有時候檢測通道也是不一樣的。
3. 熒光的選擇建議
直標還是間標(Biotin):待測抗原表達高的盡量選擇直標抗體,待測抗原表達豐度低的要考慮選間生物素標記標抗體。
熒光強弱:熒光本身有強弱之分,可視抗原表達強弱及分群情況選擇合適的熒光。如抗原表達弱或分群不明顯的建議選擇強熒光例如:PE、APC;反之,抗原表達強或分群明顯的建議選擇zui常用的弱熒光例如FITC即可(常用熒光強弱排序程度為:PE>APC>PE-cy5Cy5>PercCPp-Cycy5.5>FITC),具體熒光信息請參考熒光染料信息;
類似熒光的權衡:可以嘗試選擇新型熒光Alexa Fluor、eFluor等。因為這些熒光非常明亮,對激光穩定性好,對PH 值不敏感,具有水溶性。(如Alexa Fluor488與FITC檢測通道相同,但是熒光強度和光敏感上,前者明顯優于后者)
4. 多色熒光搭配的原則
多色分析方案中熒光抗體的選擇和搭配,會受到很多因素的制約,是一個難點:
檢測通道不能沖突:每個檢測通道只能選擇1種熒光素,各通道之間的熒光素可以隨意搭配(如FL1選擇了FITC標記的抗體,就不能再選擇Alexa Fluor488標記的抗體;而同組實驗的其余抗體選擇PE或者APC標記,都是可以隨意組合的);
熒光強弱:所選各種熒光素光譜的重疊應當盡量減少,否則將會導致較大的補償。例如,PE-Ccy5與APC同時標記,將會導致補償過度,需換成PE-Ccy5.5或PerCPcp-Ccy5.5。zui常用的4色熒光搭配是:FITC、PE、PercpPerCP-Ccy5.5、APC;
多色熒光搭配:多色分析往往會因個別抗體熒光素種類極少而受到限制,需要同時參考多家抗體公司的產品進行方案設計。因此如遇5色以上分析需求,建議咨詢萊茲生物。
5. 抗體使用劑量
同一個產品通常會提供多個規格供您選購,可以根據實驗的具體樣本量和說明書建議用量來確定抗體用量:
細胞數:通常情況下流式檢測一次的樣本量為106~108個細胞,建議對樣本做細胞計數,以保證抗體標記效果*;
Test包裝:以test為計量單位的抗體,按照每test細胞懸液體積計算出每次加入多少ul抗體即可;
Ug包裝:以ug為計量單位的抗體,需要根據說明書每次抗體加入多少ug先算出能使用的次數,再通過總體積算出每次加入多少ul抗體。
6. 同型對照抗體的選擇
同型對照(Isotype Control),是用于消除由于抗體非特異性結合到細胞表面而產生的背景染色,是真正意義上的流式陰性對照,流式細胞實驗*的一項。